การ์ดโปเกมอนญี่ปุ่นเป็นการซื้อคนละแบบกับภาษาอังกฤษ ซองเล็กกว่า มี 5 ใบแทนที่จะเป็น 10 ใบ ราคาต่อซองถูกกว่า และเดินตามปฏิทินวางจำหน่ายของญี่ปุ่น เซ็ตหนึ่งจึงมักอยู่บนชั้นในเวอร์ชันญี่ปุ่นหลายเดือนก่อนที่เวอร์ชันภาษาอังกฤษจะออกมา สต็อกญี่ปุ่นในไทยหมุนทีละเซ็ต ไม่ใช่ของที่สั่งเติมได้ตลอดเวลา รายการสินค้าหน้านี้จึงเปลี่ยนไปเรื่อย ๆ ตามที่ของหมด ทุกชิ้นรับซื้อจากตลาดมือสองที่ตรวจสอบแล้วในประเทศไทย ตรวจความแท้ภายในร้าน และมีเลขที่ Purchase Agreement ให้ตรวจสอบเองได้